当时包括尤文图斯、国际米兰和萨拉戈萨在内的多家俱乐部都在关注他，并将这位两个赛季狂轰33球的高效射手列为潜在的转会目标。 虽然国米与热那亚进行了深入的谈判，但最终米利托选择了和自己的兄弟加布里埃尔在西班牙重聚，这也是米利托第一次和蓝黑军团擦肩而过。

西甲意甲辗转，情定蓝黑军团

2005年7月，米利托从热那亚成功转会至西甲的皇家萨拉戈萨足球俱乐部。 2005年9月11日，米利托首发出场完成西甲首秀。9月21日，皇家萨拉戈萨在西甲第4轮3比1战胜奥萨苏纳，米利托在比赛的第50分钟打进了个人在西甲赛场上的首粒进球。2006年 2月8日，皇家萨拉戈萨在西班牙国王杯半决赛第一回合6比1大胜皇家马德里，米利托在比赛中独中四元大放异彩。整个05-06赛季，米利托代表皇家萨拉戈萨在西甲联赛中出场36次，打进14球；在西班牙国王杯中出场5次，打进6球，帮助皇家萨拉戈萨夺得西班牙国王杯亚军。

但命运似乎总是爱和米利托开玩笑，在她来到西甲的第三年，也就是07-08赛季，虽然米利托贡献了15球和6次助攻，但萨拉戈萨和热那亚一样不幸降级，米利托的前途又充满了未知数。但神奇的是这一年热那亚在经过两年蛰伏后成功的升入了意甲，而米利托最终以租借的形式回到了热那亚这个他欧洲足球生涯的起点。

在回到热那亚后，30岁的米利托开始爆发出自己的能量。在08-09赛季，他代表热那亚在意甲联赛中出场31次，打进24球，助攻6次，帮助热那亚夺得意甲第五名。场均逼近1球的超高效率让意甲列强都注意到了这个回归亚平宁的阿根廷神锋，而国际米兰第二次将他列为了转会的头号目标，彼时穆里尼奥正在为失去伊布而发愁，而命运将米利托和魔力鸟终于连接到了一起。

穆里尼奥打造，神锋闪耀欧洲

2009年伊布的离开对穆里尼奥是个沉重的打击，伊布作为进攻支点的辅助进攻能力和本身超强的终结能力都是不可替代的。但是伊布对诺坎普的向往让他最终做出了转会的决定。作为补偿穆里尼奥得到了4600万欧元现金，身价2000万欧元的埃托奥，还有赫莱布的一年免费租借。穆里尼奥拿着这些资金打造了国米三冠王的核心阵容，其中最重要的一笔签约就是用2500万欧元签下了热那亚的头号射手米利托。